通常，肛瘘是肛周脓肿的后遗症。其临床特点是，肛门周围有一个外口，反复地有稠水从外口流出，肛门潮湿瘙痒，永无干燥之日。当人体过劳免疫功能下降时，常可重新感染产生红肿热痛的症状
作者在临床实践中发现，不少肛瘘病人治疗疾病不及时，病史在5~10年或更长时间的并非少见。实际上，肛瘘病人不能拖延治疗，在肛周脓肿破溃或切排后3~6个月接受手术是比较理想的。
拖延治疗不仅增加病人痛苦，更能使病情逐渐发展。由于反复感染，可使单一肛瘘发展成多发性肛瘘，或由原来低位和简单肛瘘演变成深位的复杂性肛瘘，使手术治疗难度大大增加，个别复杂性肛瘘即使手术也很难根治。
更为严重的是，肛瘘病人随着病程的延长，癌变的几率可提高。1936年到1955年，英国圣马克医院肛肠科就报道过8例肛瘘并发直肠癌的病人。1981年，盖茨等查阅文献统计到肛瘘癌变病倒近150例。同年，日本大肠癌研究会统计，日本全国已发现肛瘘癌变，病史5年以上者95例，10年以上者80例。1985年日本高野正博报道，19例深部复杂性肛瘘中有2例发生癌变。
一般而言，大多数肛瘘的恶变为黏液腺癌，少数可见腺癌、胶样腺癌和鳞癌等。专家们认为，长期的慢性炎症刺激以及人体免疫功能低下，可能是肛瘘癌变的原因，而硬结形成、黏液分泌增多以及疼痛加剧，则为癌变的先兆。对于病史10年以上的肛瘘患者，尤需警惕癌变的发生。
由此可见，肛瘘一旦诊断明确，则应及时治疗，拖延治疗万万不可。手术是根治肛瘘的惟一办法，高位肛瘘还可能要结合挂线疗法。
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